Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms