Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5114W4VSN8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5114W4VSN8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5114W4VSN8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms