Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3550W4VSN7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3550W4VSN7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms