Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28036V9GXJ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms