Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms