Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo3Q9Z2I4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo3Q9Z2I4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo3Q9Z2I4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo3Q9Z2I4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo3Q9Z2I4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo3Q9Z2I4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Robo3Q9Z2I4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms