Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd1Q9Z2E2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms