Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd2Q9Z2E1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd2Q9Z2E1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms