Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn7Q9Z261 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn7Q9Z261 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms