Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uso1Q9Z1Z0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms