Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Setbp1Q9Z180 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Setbp1Q9Z180 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Setbp1Q9Z180 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Setbp1Q9Z180 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Setbp1Q9Z180 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Setbp1Q9Z180 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Setbp1Q9Z180 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Setbp1Q9Z180 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Setbp1Q9Z180 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Setbp1Q9Z180 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Setbp1Q9Z180 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Setbp1Q9Z180 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms