Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cpne6Q9Z140 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms