Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmg20bQ9Z104 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmg20bQ9Z104 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms