Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip2Q9Z0H8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms