Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Msl3Q9WVG9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Msl3Q9WVG9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msl3Q9WVG9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msl3Q9WVG9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms