Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slit3Q9WVB4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit3Q9WVB4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Slit3Q9WVB4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Slit3Q9WVB4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slit3Q9WVB4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Slit3Q9WVB4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slit3Q9WVB4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slit3Q9WVB4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms