Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArcQ9WV31 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms