Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AtrnQ9WU60 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AtrnQ9WU60 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AtrnQ9WU60 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AtrnQ9WU60 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AtrnQ9WU60 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AtrnQ9WU60 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AtrnQ9WU60 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms