Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn5Q9WU28 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn5Q9WU28 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms