Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn4Q9WU22 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms