Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skp1Q9WTX5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skp1Q9WTX5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skp1Q9WTX5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms