Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc2Q9R244 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc2Q9R244 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms