Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorbs3Q9R1Z8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms