Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb3Q9R1P1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms