Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubd1Q9R1K7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubd1Q9R1K7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms