Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slit2Q9R1B9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit2Q9R1B9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Slit2Q9R1B9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Slit2Q9R1B9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Slit2Q9R1B9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Slit2Q9R1B9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit2Q9R1B9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit2Q9R1B9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit2Q9R1B9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit2Q9R1B9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slit2Q9R1B9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms