Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfwd2Q9R1A8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms