Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SrpxQ9R0M3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms