Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NrkQ9R0G8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NrkQ9R0G8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NrkQ9R0G8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms