Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcamQ9R069 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcamQ9R069 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcamQ9R069 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms