Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2afyQ9QZQ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2afyQ9QZQ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms