Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms