Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ripk3Q9QZL0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk3Q9QZL0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms