Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn8Q9QZ49 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn8Q9QZ49 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn8Q9QZ49 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms