Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phtf1Q9QZ09 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phtf1Q9QZ09 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms