Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nphp1Q9QY53 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp1Q9QY53 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms