Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd4Q9QY39 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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