Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pkp3Q9QY23 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp3Q9QY23 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms