Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxe3Q9QY14 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms