Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jag1Q9QXX0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jag1Q9QXX0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Jag1Q9QXX0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms