Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc7a8Q9QXW9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc7a8Q9QXW9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms