Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip4Q9QXN3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms