Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rad18Q9QXK2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms