Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mid2Q9QUS6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid2Q9QUS6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid2Q9QUS6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms