Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Trpc4Q9QUQ5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc4Q9QUQ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc4Q9QUQ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Trpc4Q9QUQ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc4Q9QUQ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Trpc4Q9QUQ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Trpc4Q9QUQ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Trpc4Q9QUQ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpc4Q9QUQ5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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