Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk1eQ9JMK2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms