Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cul3Q9JLV5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul3Q9JLV5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms