Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Higd1aQ9JLR9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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