Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AatfQ9JKX4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AatfQ9JKX4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AatfQ9JKX4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms