Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf3Q9JKL4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf3Q9JKL4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms